ঠাকুরগাঁও জেলার বিভিন্ন ঐতিহাসিক স্থাপনা ও প্রত্নতাত্ত্বিক নিদর্শনের মধ্যে বালিয়া মসজিদ অন্যতম। জনশ্রুতি আছে যে এক অমাবস্যার রাতে কিছু জ্বীন এই এলাকার উপর দিয়ে উড়ে যাওয়ার সময় এখানে একটি মসজিদ নির্মাণের সিদ্ধান্ত নেয় এবং তারা সারা রাত মসজিদ নির্মাণ করতে থাকে। রাত শেষে ভোর হলে মসজিদের গম্বুজ নির্মাণের কাজ বাকি থাকে। অতঃপর জিনরা মসজিদটি অসমাপ্ত রেখে চলে যায়। পরবর্তী শত বছর ধরে এই বালিয়া মসজিদটি একটি গম্বুজবিহীন পরিত্যক্ত ছিল। 2005 সালে বালিয়া মসজিদের সংস্কার কাজ শুরু হয়। পরে 2010 সালে, মসজিদটি মুসল্লিদের জন্য খুলে দেওয়া হয়। এই জনপ্রিয় অনুষ্ঠানের জন্য বালিয়া মসজিদ জ্বীনের মসজিদ নামে পরিচিত।
ঐতিহাসিক তথ্য অনুযায়ী, বালিয়ার এক জমিদারের কন্যা গুলমতি চৌধুরানীর স্বামী মেহের বক্স চৌধুরী 'বালিয়া মসজিদ' নির্মাণ করেন। কিন্তু মসজিদটির নির্মাণ তারিখ সম্পর্কে সঠিক কোনো তথ্য পাওয়া যায় না। মসজিদের শিলালিপি অনুসারে, এই মসজিদটি 1317 বঙ্গাব্দে (ইংরেজি বছর 1910) নির্মিত হয়েছিল। আবার মেহের বক্স চৌধুরী ১৩১৭ বাংলায় মৃত্যুবরণ করেন। তাই মেহের বক্স চৌধুরীর মৃত্যুর কারণে বালিয়া মসজিদের নির্মাণ কাজ অসম্পূর্ণ ছিল বলে ধারণা করা হয়।
ঢাকার বিভিন্ন মুঘল ভবনের বালিয়া মসজিদের সাথে সাদৃশ্য পাওয়া যায়। মসজিদ কমপ্লেক্স তিনটি অংশ নিয়ে গঠিত: প্রধান ফটক, খোলা চত্বর এবং মূল ভবন। আর মূল মসজিদটি স্তম্ভবিহীন ৪২ ইঞ্চি চওড়া দেয়ালে নির্মিত। পূর্ব-পশ্চিমে 62 ফুট 6 ইঞ্চি এবং উত্তর-দক্ষিণে 69 ফুট 2 ইঞ্চি পরিমাপের আয়তাকার মসজিদটি সমতল থেকে প্রায় 5 ফুট 3 ইঞ্চি উঁচু একটি প্ল্যাটফর্মে দাঁড়িয়ে আছে।
বালিয়া মসজিদের ছাদ মেঝে থেকে প্রায় ১৭ ফুট উপরে এবং এতে ৩টি গম্বুজ ও ৮টি মিনার রয়েছে। চুন-সুরকি, হাতে পোড়ানো ইট ও টালি দিয়ে নির্মিত মসজিদের দেয়ালে লাল ইটের নকশায় পদ্ম, কলস, ঘণ্টা, আমলকি ও থালা-বাটি খোদাই করা হয়েছে।